Department of Botany

More ...

About Department of Botany

Facts about Department of Botany

We are proud of what we offer to the world and the community

16

Publications

185

Students

50

Graduates

Programs

Major

...

Details

Publications

Some of publications in Department of Botany

" الخصائص الجزيئية لعزلات فطر Alternaria solaniعلى نبات الطماطم Lycopersicum esculentum Mill "

"يسبب مرض اللفحة المبكرة early blight أضراراً كبيرة للمجموع الخضري على نباتات العائلة الباذنجانية ومنها الطماطم. جُمعت خمسة عشرة عزلة (12 عزلة من الطماطم، عزلتان من البطاطس عزلة واحدة من الفلفل) لفطر A. solani من مصادر مختلفة بطرابلس. أُجريت بعض الدراسات الحقلية والمعملية لتحديد الاختلافات بين تلك العزلات، وذلك من حيث السلوك المزرعي على الوسط الغذائي PDA، الخصائص الظاهرية، القدرة الإمراضية والاختلافات الجزيئية. أظهرت مستعمرات العزلات المختبرة اختلافاً فيما بينها عند إستنباتها على الوسط الغذائي PDA يتراوح بين النمو القطني الى المسطح وبلون زيتوني الى زيتوني غامق. أنتجت العزلات صبغات غيرت من لون الوسط الغذائي الذي تراوح بين اللون الرمادي والبني. بينت دراسة الخصائص الظاهرية للفطر تكون حوامل كونيدية قصيرة تحمل جراثيم كونيدية تختلف في عددها من عزلة إلى أُخرى فهي إما جرثومة كونيدية مفردة أو على هيئة سلاسل من جرثومتين؛ كما أوضحت الدراسة وجود فروقات معنوية في حجم كونيديا عزلات الفطر، تتراوح أبعادها من 23.45 الى 46.90 × 7.70 الى 14.00 ميكرومتر. أظهرت العزلات تبايناً كبيراً عند اختبار قدرتها الإمراضية على ثمار، نباتات وأوراق طماطم منفصلة، تراوحت بين شديدة، متوسطة الى ضعيفة الإمراضية. إن دراسة التنوع الوراثي لعزلات فطر A. solani باستخدام RAPD-PCR وبادئات عشوائية قصيرة، قد أظهر اختلافات معنوية تمثلت في وجود أنماط مختلفة من حزم DNA متعددة وأُحادية المظهر. استطاعت ثلاث بادئات من أصل عشرة (OPA-07، OPA-09، OPJ-09) تحديد البصمة الوراثية للعزلات الخمسة عشر، وقد أظهر التحليل العنقودي لنواتج RAPD-PCR أن البادئ OPA-07 تمكن من تصنيف العزلات إلى خمس مجموعات: مجموعة A (TF4، TF7، TL1، TL3)، مجموعة B (TF1، TF3، TF8، PEF) مجموعة C (TF5، TF6، TF9، POL1، POL2)، في حين ان العزلتين المتبقيتين TL2 و TF2 ذات نمط تحزيمي فريد أُطلق عليهما المجموعة U1 و U2 على التوالي. أما البادئ OPA-09 فقد وضع العزلات في أربعة مجاميع وهي: مجموعة A (TF4، TF6، TF7، TF8، TL2)، مجموعة B (POL1، TL3، TF3)، مجموعة C (TF5، POL2) ومجموعة D (TL1، TF1، TF2 TF9، PEF). في حين ان البادئ OPJ-09 قد أستطاع تصنيف تلك العزلات الى أربعة مجاميع وراثية محددة هي: مجموعة A (TF1، TF7، TL3، PEF)، مجموعة B (TF3، TF8، POL2) مجموعة C (TF2، TF6، TF9، TL2) ومجموعة D (TF4، TF5). لقد برهنت نتائج RAPD-PCR على وجود اختلافات جزيئية جديرة بالإهتمام بين عزلات A. solani أمكن من خلالها تصنيف تلك العزلات ضمن مجموعات مختلفة وأنماط فريدة، دون وجود علاقة تربط بين مجاميع الأنماط العنقودية وكل من العائل النباتي، الخصائص الظاهرية والقدرة الإمراضية لتلك العزلات. Abstract Early blight disease causes severe damage to the foliar part of solanaceous crops including tomato. Fifteen isolates (12 from tomato, 2 from potato, 1 from pepper) were collected from different sources in Tripoli. Field and laboratory studies were conducted to determine cultural behaviour on PDA medium, morphological, pathogenic and molecular variation between isolates tested. Colonies of isolates revealed variation in their cultural behaviour on PDA medium ranging from cottony to appressed growth, with colour ranging between light to dark olivaceous. The pigments released by the isolates changed the medium colour to grey or brown. Morphological studies of the fungal isolates exhibited short conidiophores bearing a single or chains of paired conidia. This study revealed a significant variation in conidial size for the isolates tested ranging from 23.45 to 46.90 x 7.70 to 14.00 µm. Pathogenicity testes on fruits, plants, and detached leaves of tomato indicated a high significant variation between isolates tested ranging from highly to moderate or weak pathogenic. Genetic diversity of A. solani isolates using RAPD-PCR with oligonuclotide primers revealed significant differences in the appearance of polymorphic and monomorphic banding patterns. Three primers (OPA-07, OPA-09, OPJ-09) out of ten were able to determine the genetic fingerprints of tested isolates. Cluster analysis of RAPD-PCR products showed that primer OPA-07 was able to classify the isolates into five groups: group A (TF4,TF7, TL1, TL3), group B (TF1,TF3, TF8, PEF), group C (TF5, TF6, TF9, POL1, POL2), whereas the remaining two isolates TL2 and TF2 were unique in their patterns and were designated as group U1 and U2 respectively. Primer OPA-09 revealed four distinct genetic groups designated as: group A (TF4, TF6, TF7, TF8, TL2), group B (POL1, TL3, TF3), group C (TF5, POL2) and group D (TL1, TF1, TF2, TF9, PEF). However primer OPJ-09 was able to split the isolates tested into four distinct clusters: group A (TF1, TF7, TL3, PEF), group B (TF3, TF8, POL2), group C (TF2, TF6, TF9, TL2) and group D (TF4, TF5). The results of RAPD-PCR demonstrate existence of considerable variation in molecular characteristics of A. solani isolates. Accordingly these isolates were classified into different groups and unique patterns with no obvious association between the pattern of clustering of the isolates and their host of origin, morphological characteristics and pathogenicity"
هاجر محمد الصويد (2014)
Publisher's website

" المكافحة الحيوية بأستخدام عزلات محلية لفطر Trichoderma spp ضد فطر Sclerotinia sclerotiorum "

Abstract This study was conducted to evaluate in vitro and in vivo antagonistic activities of five Trichoderma isolates; three local (Lib1, Lib2, Lib3) and two commercial (T22, Tp1) against mycelium radial growth and sclerotia formation of the plant pathogenic fungus Sclerotinia sclerotiorum, and its effect on seed germination and infection of pea (Pisum sativum L.) seeds. All experiments were conducted at two growth temperatures, 20 and 25˚C. Microscopic interactions of Trichoderma isolates and host fungus were performed by slide culture technique. Two concentrations (10, 20%) of Trichoderma culture filtrate were tested for their effect on mycelium growth. All Trichoderma isolates were able to inhibit the growth of the fungal pathogen, although, variations were observed among tested isolates in rate and mechanisms of inhibition. At 25⁰C Lib2 showed the highest rate of mycelium growth and spore formation. In mycoparasitism, the inhibition rate was 55% for Lib3 and 45% for Lib1. Whereas for indirect interactions; significant inhibition of mycelium radial growth was observed for Lib1 and Tp1 with a percentage of 28.5 and 26.4 respectively. Overgrowth was also reported on the colonies of S. sclerotiorum by Lib2 and T22, and these two isolates showed remarkable inhibition of sclerotia formation with a percentage rate of 91. The effect of culture filtrate of Trichoderma isolates was dose dependent, 20% concentration of culture filtrate lowered the rate of radial growth of S. sclerotiorum by 53% for Lib1 and 47.2% for Tp1, while lower inhibition of Sclerotinia radial growth was reported for 10% concentration of culture filtrate with a percentage of 45 for Lib1 and 34 for Tp1. At 20⁰C 10% and 20% culture filtrate exhibited lower effect on mycelium radial growth of Sclerotinia. Seed germination of peas (local variety) was enhanced by Trichoderma treatment. Increased rate of seed germination was reported by 96.6% for Lib1, Lib2 and 80% for Lib3 and 76% for Tp1, lower inhibitory effect was reported for T22 by 43%. Seed treated with Trichoderma isolates exhibited low rate of seedlings infection by S. sclerotiorum.
عواطف علي شليبيك (2013)
Publisher's website

" تأثير النفط الخام في إنبات ونمو بعض المحاصيل الزراعية "

" يشمل هذا البحث دراسة تأثير تركيزات مختلفة من النفط الخام على إنبات البذور وإطالة الباذرات في محاصيل الذرة Zea mays والعدس Lens culinarisوالحمص Cicer arietinum والفاصوليا Phaseolus vulgaris L ، كما يشمل هذا البحث دراسة تأثير تركيزات مختلفة من النفط الخام على نمو هذه المحاصيل في التربة .التركيزات المنخفضة من النفط الخام في الماء ليس لها تأثير على معدل الإنبات والإنبات النهائي لحبوب الذرة وبذور العدس والفاصوليا في المعمل ، بينما التركيزات العالية لها تأثير مثبط على معدل الإنبات والإنبات النهائي لهذه البذور المستعملة في المعمل. جميع تركيزات النفط الخام المستعملة تؤثر في معدل الإنبات والإنبات النهائي لبذور الحمص المستعملة في المعمل. جميع تركيزات النفط الخام لها تأثير على معدل الإنبات والإنبات النهائي لحبوب الذرة في التربة.التركيزات المنخفضة من النفط الخام لا تؤثر في إطالة باذرات الذرة ، بينما التركيزات العالية كان لها تأثير مثبط على إطالة الباذرات في التربة.التركيزات المنخفضة من النفط الخام زادت من الوزن الطري والوزن الجاف في جميع أجزاء نبات الذرة ، بينما التركيزات العالية أدت إلى تثبيط الوزن الطري والوزن الجاف لهذه النباتات.جميع تركيزات النفط الخام المستعملة تثبط من معدل الإنبات والإنبات النهائي لبذور الفاصوليا في التربة ، أوضحت نتائج قياسات أطوال نباتات الفاصوليا أن تركيزات النفط الخام المنخفضة لا تؤثر في أطوال نباتات الفاصوليا، بينما التركيزات العالية من النفط الخام تنقص من أطوال نبات الفاصوليا. التركيزات المنخفضة من النفط الخام تزيد من الوزن الطري والوزن الجاف للمجموع الجذري والسيقان والأوراق لنباتات الفاصوليا ، ولكنها تثبط الوزن الطري للثمار، بينما التركيزات العالية من النفط الخام تثبط الوزن الطري والوزن الجاف لجميع أجزاء نبات الفاصوليا.جميع تركيزات النفط الخام تثبط معدل الإنبات والإنبات النهائي لبذور العدس ، كما أن جميع تركيزات النفط الخام ليس لها تأثير في إطالة باذرات نبات العدس في التربة.جميع تركيزات النفط الخام المستعملة أدت إلى تثبيط معدل الإنبات والإنبات النهائي لبذور الحمص ، كما أنها أدت إلى زيادة في إطالة باذرات الحمص في التربة .ومن نتائج تحليل التربة المعاملة بالنفط الخام تبين أنه لا يوجد فروق كبيرة بين عناصر المنجنيز والنيكل والفسفور مقارنة بالتربة الغير معاملة ، بينما تبين أن هناك زيادة كبيرة في محتوى التربة المعاملة بالنفط الخام بعنصر الكربون والمواد العضوية الأخرى . Abstract The effect of different concentrations of crude oil on seed germination and seedling elongation of Zea mays, Lens culinaris, Cicer arietinum and Phaseolus vulgaris were tested. The effect of different concentrations of crude oil on seed germination and seedling growth in petri dishes and in soil were tested Low concentrations of crude oil used in this work showed no effect on both rate and final germination of Zea mays ,Lens culinaris and Phaseolus vulgaris seeds in the laboratory while higher concentrations had an inhibitory effect on both rate and final germination in laboratory All concentrations of crude oil had an inhibitory effects on both rate and final germination of Cicer arietinum seeds in laboratory. All concentrations of crude mixed with the soil used showed an inhibitory effect on both rate and final germination of Zea mays grain. Low concentrations of crude oil showed no effect on seedling growth of Zea mays, while higher concentrations had an inhibitory effect in the soil. Low concentrations of crude oil had increased the fresh weight in all parts of Zea mays plants, while higher concentrations of crude oil decreased fresh weight of Zea mays. All concenterations of crude oil increased dry weight in all parts of corn plants, while high concentrations of crude oil decreased dry weight of Zea mays All concentrations of crude oil had an inhibitory effect on both rate and final germination of Phaseolus vulgaris seeds . All concentrations of crude oil showed no effect on seedling growth of Phaseolus vulgaris plants. Fresh and dry weight of shoot, leaves and root system of Phaseolus vulgaris was increased by low concentrations of crude oil, but these treatments decreased fresh weight of fruits. However higher concentrations of crude oil decreased fresh and dry weight of this plant speices. All concentrations of crude oil had an inhibitory effect on both rate and final germination of lens culinaris seeds, while all concentrations of crude oil showed no effect on growth of lens culinaris seedlings. All concentrations of crude oil had an inhibitory effect on both rate and final germination of Cicer arietinum seeds. While all concentrations of crude oil increasd growth of Cicer arietinum seedlings. The results of chemical analysis of soil-treated with crude oil revealed that oil treated soil contain as greater proportion of carbon and organic materials compared with untreated soil. "
مها عبد العال الصابري (2012)
Publisher's website