Digital Repository for Department of Microbiology & Immunology

Statistics for Department of Microbiology & Immunology

  • Icon missing? Request it here.
  • 1

    Conference paper

  • 8

    Journal Article

  • 0

    Book

  • 0

    Chapter

  • 0

    PhD Thesis

  • 2

    Master Thesis

  • 0

    Final Year Project

  • 0

    Technical Report

  • 0

    Unpublished work

  • 1

    Document

Comparative assessment of a DNA and protein Leishmania donovani gamma glutamyl cysteine synthetase vaccine to cross-protect against murine cutaneous leishmaniasis caused by L. major or L. mexicana infection

Leishmaniasis is a major health problem and itis estimated that 12 million people are currently infected.A vaccine which could cross-protect people against different Leishmania spp. would facilitate control ofthis disease as more than one species of Leishmania may be present. In this study the ability of a DNA vaccine, using the full gene sequence for L. donovani gamma glutamyl cysteine synthetase (GCS) incorporated in the pVAX vector (pVAXGCS), and a protein vaccine, using the corresponding recombinant L. donovani GCS protein (LdGCS),to protect against L. major or L. mexicana infection was evaluated. DNAvaccination gave transient protection against L. major and no protection against L. mexicana despite significantly enhancing specific antibody titres in vaccinated infected mice compared to infected controls. Vaccination with the LdGCS protected against both species but only if the protein was incorporated into non-ionic surfactant vesicles for L. mexicana. The results of this study indicate that a L. donovani GCS vaccine could be used to vaccinate against more than one Leishmania species but only if the recombinant protein is used. arabic 30 English 176
Basma Doro, (12-2012)

Blood donors status of HIV, HBV and HCV in Central Blood Bank in Tripoli, Libya

virus infection continues to be an important public health concern with regard to blood transfusion in Libya and in Africa. This concern is related to the screening test. Objectives: The main aim of this study to investigate the blood donors samples for HIV, HBV and HCV infections in Tripoli-Libya, North Africa during the first five months of 2015. Methods: The total of 686 blood samples obtained from healthy blood donors who attended Tripoli’s central blood bank, were tested for HBsAg, HCV and HIV using the VITROS® 3600 Immunodiagnostic System. Results: From the 686 samples examined, the frequency of HBsAg positive cases was 0.8%, the number of anti-HBc positive samples was found to be particularly high in the age group 29 and 36 years (p= 0.0001). The number of anti-HBc positive samples was found to be particularly high in the age group 30-39 years (p= 0.01). Most occupation that had positivity with anti-HBc and HBV-DNA were free workers and was less in students. Most positive cases were from east of Tripoli the capital (Tagora, Soq-Aljomaha). Conclusion: The frequency of HBsAg positive blood donors and anti-HBc among this sample was 0.8% and 0.7% respectively, which is low compared with the international findings. The current study estimated the expected exclusion rate of anti-HBc and HBsAg positive donated blood, as this would be an important factor to consider before donation. arabic 16 English 63
Basma Mohamed K Doro(9-2015)

Evaluation of the Efficacy of Biocides on Bacterial Strains Isolated from Tripoli Medical Centre (TMC) تقييم فاعلية المضادات غير الحيوية على السلالات البكتيرية المعزولة من مركز طرابلس الطبي

تستخدم مطهرات الارضيات ومطهرات الايدي على نطاق واسع في المستشفيات ومرافق الرعاية الصحية الأخرى لمجموعة متنوعة من التطبيقات. ومع ذلك، لا يتم دائما ذكر فعاليتها المضادة للبكتيريا بشكل جيد من قبل المنتجين والمستهلكين حيت يجدون صعوبة في اختيار المنتج المناسب وفقا لاحتياجاتهم. لذلك، كان الهدف من هذه الدراسة تقييم فعالية التضاد البكتيري لمطهرات الارضيات ومطهرات الايدي المختارة من مركز طرابلس الطبي باعتباره أحد اهم المستشفيات الليبية.  أربعة عشر (14) نوعا من مطهرات الارضيات ومطهرات الايدي.(Dex36, Dex50, Dex53, Mzid-S, Mzid-AF, Deson-AF, Dettol, Seem, Chlor and Wipol, HiBi, Esept, Emed and Desman) . تم تقييمها باستخدام أربعة أنواع من التجارب المعملية العيارية وهي: (capacity test, diffusion test, in-use test and suspension test) ضد ستة من السلالات البكتيرية ، ثلاثة من البكتيريا إيجابية الجرام وثلاثة من البكتيريا سالبة الجرام.(Bacillus cereus, Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus aureus, Klebscilla pneumonia, Acinetobacter baumannii, and Pseudomonas aeruginosa). هذه السلالات تم عزلها من بيئات مختلفة من اقسام مركز طرابلس الطبي ، وقد تم دراسة حساسيتها لمطهرات الارضيات ومطهرات الايدي بتراكيز مختلفة و فترات تحضين مختلفة ، وأظهرت النتائج أن استخدام التراكيز الموصى بها من مركبات (Dex 50 & 53 and Deson-AF) كان لها تأثير كبير على تثبيط الأنواع البكتيرية التالية:Bacillus cereus, Staphylococcus haemolyticus, staphylococcus aureus, Klebsiella pneumonia, Acinetobacter baumannii, and Pseudomonas aeruginosa..تشير النتائج الإجمالية ان مركبات (Dex50 & 53, Mzid-S, Mzid-AF, HiBi) عد استخدامها وفق التخفيفات الموصى بها ، كانت الأفضل كمطهرات ضد البكتيريا التالية:Bacillus cereus, Staphylococcus aemolyticus, staphylococcus aureus, Klebsiella pneumonia, Acinetobacter baumannii, and Pseudomonas aeruginosa إن الاستخدام الجيد والصحيح للمطهرات ضروري لتجنب الإصابة بالأمراض التي قد تنشأ من جراء انتشار مثل هده الميكروبات الممرضة.

Abstract

Biocides (disinfectants and antiseptics) are used extensively in hospitals and other health care settings for a variety of applications. However, their .ntibacterial effectiveness is not always well stated by the manufacturers and consumers find it difficult to choose the right product according to their .eeds. Therefore, the aim of this study was to evaluate practically achieves disinfection efficacy of locally available disinfectants and antiseptics on surfaces and infectious microbiological utilities of Tripoli Medical Center (TMC). Fourteen biocides; Ten disinfectants (Dex36, Dex50, Dex53, Mzid-S, Mzid-AF, Deson, Dettol, Seem, Chlor and Wipol) and four antiseptics (HiBi, Esept, Emed and Desman) were tested at concentrations .commended by manufacturers on surfaces, walls and different utilities that were ontaminated by locally circulating six isolates of .cilluscereus,Staphylococcus haemolyticus, staphylococcus aureus, Klebscilla pneumonia, Acinetobacter baumannii, and Pseudomonas aeruginosa using four standard evaluation test procedures (capacity test, diffusion test, in-use test and suspension test). Results showed the highest average log reduction (7.4) of test bacteria was given by quaternary ammonium based disinfectants; Dex50, Dex53, Deson-AF and Mzid-S. A comparable average log reduction of test bacteria was noted (7.0, 7.2 and 7.3) for Deson-AF, Dex.50 and Dex.53 respectively. In contrast HiBi as an alcoholic based antiseptic gave the highest average log reduction (7.2) gainst tested bacteria. Desman, Emed and Wipol antiseptics had poor antibacterial activity on tested bacteria causing almost undetectable log reduction in cell viability. From contamination point of view, five critical departments in Tripoli Medical Centre (TMC) namely; Neonatal Intensive Care Unit (ICU), Surgical ICU, Dermatology, Oncology, and Urology departments were found contaminated with six types of bacteria. Bacillus cereuses followed by lebscilla pneumonia were the most bacteria spread in whole five mentioned departments, particularly in dermatology department. Staphylococcus haemolyticus was next most widespread bacterium and almost isolated qually from the five medical departments. Acinetobacter baumannii had been isolated from Neonatal ICU; whereas Staphylococcus aureus and seudomonas aeruginosa had been isolated from Oncology Department and Surgical ICU respectively. In addition, Dex36, Chlor, Chlor, Wipol, Desman and E-med exhibited bacterial contaminationin both capacity and in-use ests.
آمال منصور إبراهيم (2016)

Carriage and Genetic Profile of MRSA Isolated from Pediatric Hospital

تشكل البكتيريا العنقودية الذهبية المقاومة للميتاسلين، والتي تعرف اختصارا "بالمرسا" MRSA وهي واحدة من أكثر البكتيريا الممرضة المقاومة للمضادات الحيوية، والتي تشكل مشكلة صحية خطيرة بين البالغين والأطفال، الدراسة لمثل هذا النوع من البكتيريا محدود جدا في ليبيا، وغالبا ما تكون مقتصرة على البالغين، ولا توجد أي بيانات توضح مدى انتشارها بين الأطفال. أجريت هذه الدراسة الاستطلاعية في مستشفى الأطفال بطرابلس، واستهدفت تحديد معدل تواجد هذه البكتيريا في الأنف، والتحقق من بعض خصائص المقاومة والعدائية لهذه البكتيريا، بإتباع الطرق الظاهرية والجزيئية. لتعريف عزولات بكتيريا "المرسا"، تم استخدام طرق سريعة و تقليدية، وذلك وفقا للأساليب التوجيهية القياسية فمنها ما يتعلق بتحديد النمط الظاهري مثل (طريقة انتشار القرص Kirby-Bauer's، و CRA، و (TCP، وأخرى للكشف عن النمط الجيني مثل (تفاعل البلمرة(PCR ، وذلك لفحص هذه البكتيريا، و تحديد قدرتها على إنتاج الشريط الحيوي "biofilm"، ومدى مقاومتها للمضادات الحيوية، بالإضافة إلى اختبار MATs لتحديد درجة الإسترطاب "hydrophobicity"، كما تم استخدام PFGE لتحديد النوع الجزيئي لعزولات بكتيريا "المرسا".استغرقت مدة الدراسة16 شهرا، أظهرت النتائج خلالها، أن أجمالي معدل التواجد العام لهذه البكتيريا كان%9.23 ، وفي الوقت نفسه كان معدل انتشارها بين المرضى في الأقسام (%8.3) ، وأمهات المرضى %11))، و المرضى في العيادات الخارجية (%2.19)، و موظفي الرعاية الصحية %12.36)). أوضحت النتائج أيضا ، أن هناك فرق واضح في معدل انتشار بكتيريا "المرسا" بين المرضى داخل الأقسام، والمرضى في العيادات الخارجية (P = 0.044)، كما لوحظ أن أعلى معدل لهذه البكتيريا كان يحمله مرضى العناية المركزة، وقد تم تصنيف %64من عزولات هذه البكتيريا على أنها مكتسبة من المستشفيات والمرافق الصحية، كما بينت هذه الدراسة ، أن ما نسبته 30.7 % من بكتيريا "المرسا" وجد في المرضى نزلاء المستشفى، وكانت لها مقاومة متعددة للدواء "multi-drug resistance".باستخدام طريقتي CRA و TCP وجد أن: 45.71% من عزولات بكتيريا "المرسا" كانت مكونة للشريط الحيوي ْ"biofilm" باستخدام طريقة CRAوعندما تم استخدام طريقة TCP، كانت نسبة عزولات بكتيريا "المرسا" القادرة على تكوين الشريط الحيوي هي 48.57 %، كافة الأجناس من بكتيريا "المرسا"، أظهرت أن لها خاصية الاسترطاب "hydrophilic character"، كما أن نتائج تفاعل البلمرة PCR بينت أن %100 من هذه البكتيريا التي تم فحصها هي حاملة للجين mecA، جينات أخرى تم الكشف عنها بنسب مختلفة، وهي كالتالي luksPV ، fnbA ، icaA/icaD ، cna ، بنسب مئوية هي: 28.57%، %71.82، 60.0% 34.28% ، على التوالي ، بينما الجين نوع clfA لم يتم الكشف عنه ، كان الجين ermCالأكثر وجودا بنسبة 69.23%، ثم يتبعه الجين ermBبنسبة 46.15%، وبعدها الجين msrA بنسبة 38.46%، وأخيرا الجين ermA بنسبة 15.38%.كما برهنت هذه الدراسة، أن أجناس بكتيريا "المرسا" المفوعة، التي تحوي الجين المسؤول عن PVL، والتي لها القدرة على تكوين الشريط الحيوي، هي من أكثر الأجناس احتمالية في زيادة ظهور الالتهابات الحادة، كما أوضحت هذه الدراسة أيضا، أن غالبية بكتيريا "المرسا" تحتوي على جين التصاق واحد على الأقل من نوع fnbA، ولكن ليست جميعها قادرة على تكوين الشريط الحيوي، وقد وجد أن النوع A هو الأكثر تواجدا في PEGE. دراسات أخرى مطلوبة لتعيين جميع خصائص النمط الجيني لعزولات بكتيريا "المرسا".
اميمه حسن الحداد (2012)